आयकर महानिदेशालय (छूट), नर्इ दिल्ली सात मेट्रो स्टेशनों अर्थात अहमदाबाद, बंगलौर, चेन्नर्इ, दिल्ली, हैदराबाद, कोलकाता और मुंबर्इ में स्थित आयकर निदेशालय (छूट) पर प्रशासनिक नियंत्रण रखता है। छूट निदेशालय आयकर अधिनियम, 1961 में छूट से संबंधित विभिन्न प्रकार की स्वीकृतियों में संलग्न है। इसके अलावा, यह कर छूट प्राप्त संस्थाओं (राजनीतिक दलों को छोड़कर) की कर विवरणियों के प्रशासन व आयकर अधिनियम, 1961 में छूट से संबंधित विभिन्न प्रावधानों के कार्यान्वयन के लिए जिम्मेदार है।